کارگاه طراحی پرایمر

پرایمر، یک مولکول کوچک تک رشته ای از جنس DNA  است که در واکنش PCR  شرکت میکند و سر 3 ′ هیدروکسیل آزاد را در اختیار «آنزیمTaq  پلیمراز» قرار میدهد. میدانیم که در ژنوم موجودات پیچیده ای مانند انسان، در هر ناحیه، تنها یکی از دو رشته DNA به عنوان ژن فعال، عمل میکند. معمولا هدف از انجام PCR  ، تکثیر این ناحیه است و به آن «ناحیه هدف(Target  »Region) میگوییم. برای این کار به دو پرایمر نیاز است که یکی به رشته هدف و دیگری به رشته مکمل آن متصل میشود.

این دو پرایمر، به ترتیب، «پیشرو» )Forward(  و «معکوس» )Reverse( نام دارند و با حرو ف اختصاری F  و R نشان داده میشوند. اتصال پرایمرها به مولکول الگو بر پایه پیوندهای هیدروژنی استوار است و در هر رشته، سر 5 ′ پرایمر به سر 3 ′مولکول الگو متصل میشود.